一条河流的广义水文系统包括从发源地直到河1：3的上中下游地带的地下水与地表水系统，流域中由河流串联起来的湖泊、湿地、水塘、沼泽和洪泛区。水域生态系统作为一个大系统，其子系统包括生物系统、广义水文系统和人造工程设施系统。广义水文系统与生物系统交织在一起，形成自然河流生态系统。而人类活动和工程设施作为生境的组成部分，对于水域生态系统产生影响。如果仅仅考虑河道本身的生态修复问题，显然是把复杂系统简单割裂开了。水域生态系统受到胁迫时，需要对于各种胁迫因素之间的相互关系进行综合、整体研究。因此，在进行生态水利工程设计时，充分掌握生态系统各个要素问的相互作用，不是仅仅考虑河道水文系统的修复问题，也不仅仅是修复单一动物或修复河岸植被，而应考虑整个水域的生态系统修复，提出修复河流生态系统的整体、综合的系统方法。

　　(四)重视河床岸坡的防护建设

　　岸坡防护工程的设计应从强调人与自然和谐的生态建设要求出发，采用与周围自然景观协调的结构形式，在满足工程安全的前提下，确保生态和景观的护岸形式多种多样。因为在河流整治工程中，对生态系统冲击最大的因素是水陆交错带的岸坡防护结构。在典型的岸坡防护结构中，可尽量使用具有良好反滤和垫层结构的堆石，多孔混凝土构件和自然材质制成的柔性结构，尽可能避免使用硬质不透水材料，如混凝土、浆砌块石等，为植物生长，及鱼类、两栖类动物和昆虫的栖息与繁殖创造条件。水陆交错带是水域中植物繁茂发育地，为动物的栖息、觅食、产卵之避难所，也是陆生、水生动植物的生活迁移区，至关重要。

　　(五)在防洪建设规划中融入生态建设

　　以往的治河工程着眼于河流本身，往往忽略了河流湖泊与岸上生态系统的有机联系，忽视了河流周围的生物群落的存在，也常常忽视了整治后原有生物群落的恢复。工程经济效益和环境效益分析方面应加强，即进行工程项目经济技术及生态环境效益评估，权衡满足人的需求的经济效益与环境效益之间的关系，改变现行的单一经济技术评估指标体系。因此，建议按照“河流生态廊道”的范围，进行统一规划、设计和建设。在进行防洪工程的规划时，应明确河流与其上下游、左右岸的生物群落处于一个完整的生态系统中。在平时的设计当中除说明需进行常规的水文、地质的测量勘察外，还要补充加强相关范围的生态系统调查的要求，重点是生物群落(动物、植物)的历史与现状调查，对特定的生物群落与水体的相互依存的关系有明确的认识。

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